Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Hoxd12P23812 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms