Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PrkchP23298 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PrkchP23298 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PrkchP23298 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms