Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SftpcP21841 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
SftpcP21841 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms