Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tpm3P21107 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpm3P21107 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms