Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tnnc2P20801 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms