Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Hoxb9P20615 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb9P20615 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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