Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcaP20444 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms