Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
P20040 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
P20040 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
P20040 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
P20040 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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