Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Sptan1P16546 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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