Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PrphP15331 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PrphP15331 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PrphP15331 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms