Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Vpreb2P13373 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms