Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Vpreb1P13372 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms