Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Msx1P13297 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Msx1P13297 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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