Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Calb1P12658 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms