Protein–RNA interactions for Protein: P11416

Rara, Retinoic acid receptor alpha, mousemouse

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaraP11416 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RaraP11416 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RaraP11416 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RaraP11416 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RaraP11416 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RaraP11416 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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