Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prf1P10820 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms