Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
P10404 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
P10404 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
P10404 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
P10404 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
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