Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CatspereP0DP43 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CatspereP0DP43 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms