Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb1P09055 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms