Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Col4a2P08122 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Col4a2P08122 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms