Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04212 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P04212 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P04212 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P04212 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P04212 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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