Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Mtnd1P03888 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Mtnd1P03888 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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