Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tp53P02340 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tp53P02340 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms