Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01736 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01736 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01736 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01736 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms