Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifnb1P01575 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifnb1P01575 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms