Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CopeO89079 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CopeO89079 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CopeO89079 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CopeO89079 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CopeO89079 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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