Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nptx2O70340 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nptx2O70340 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms