Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cldn5O54942 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Cldn5O54942 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Cldn5O54942 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms