Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Limk2O54785 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Limk2O54785 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Limk2O54785 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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