Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cavin1O54724 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cavin1O54724 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms