Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sdc4O35988 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sdc4O35988 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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