Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Psmb10O35955 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms