Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Clk2O35491 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Clk2O35491 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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