Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tnfrsf11aO35305 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms