Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Pitx3O35160 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pitx3O35160 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms