Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Polr1aO35134 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Polr1aO35134 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms