Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Casq1O09165 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Casq1O09165 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Casq1O09165 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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