Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snap23O09044 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snap23O09044 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms