Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ27

Ccdc191, Coiled-coil domain-containing 191, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc191J3QQ27 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc191J3QQ27 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc191J3QQ27 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.4 ms