Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm13423-201ENSMUST00000117205 888 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rpl5-ps2-201ENSMUST00000119057 891 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm27042-201ENSMUST00000181109 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm28514-201ENSMUST00000187488 450 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm44395-201ENSMUST00000197056 153 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 AC154838.3-201ENSMUST00000228876 965 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Tmco5-201ENSMUST00000028834 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm16299-201ENSMUST00000162724 2766 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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Gm21887J3QQ04 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Olfr907-203ENSMUST00000214264 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Gm21887J3QQ04 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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