Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Gm8356J3QPD3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms