Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam240aJ3QNP9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Fam240aJ3QNP9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Fam240aJ3QNP9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Fam240aJ3QNP9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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