Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Gm20918J3QN17 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20918J3QN17 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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