Protein–RNA interactions for Protein: J3QN14

Zfp616, Zinc finger protein 616, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp616J3QN14 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Zfp616J3QN14 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms