Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm3415J3QMS8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm3415J3QMS8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms