Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm20825J3QM67 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms