Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm21411J3KMS0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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