Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm20830J3KML6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm20830J3KML6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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