Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Sclt1G5E861 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms