Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcf11G3X9Z4 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcf11G3X9Z4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcf11G3X9Z4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcf11G3X9Z4 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcf11G3X9Z4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms